Фамилия Кутыржина (мужская форма — Кутыржин) — редкий пример, где суффикс -ин указывает на принадлежность не к личному имени, а к прозвищу, которое, скорее всего, описывало внешность, поведение или род занятий. Основа «кутыр-» звучит не по-русски гладко, что наводит на мысль о диалектном или иноязычном корне.

Самая вероятная версия связывает фамилию с южнорусским или украинским словом «кутырь» (или «кутыр»). В говорах так называли нечто вздутое, надутое, например, пузырь, волдырь, а также — в переносном смысле — обидчивого или надутого человека. Прозвище Кутыр мог получить либо человек с заметной внешней особенностью (например, с родинкой или шишкой), либо тот, кто часто дулся, сердился. Суффикс -ин (а не -ов) типичен для фамилий, образованных от слов женского рода или от прозвищ на -а/-я, но здесь он закрепился по модели «чей?»: сын Кутыри, то есть Кутыржин.

Вторая, менее распространённая гипотеза отталкивается от слова «кутырзаться» — то есть возиться, копаться, делать что-то медленно. В этом случае прозвище Кутырза давали нерасторопному или придирчивому человеку. Однако в таком варианте фамилия скорее звучала бы как Кутырзин, а форма с «ж» указывает на более старую, диалектную основу.

Географически фамилия Кутыржин встречается в основном в центральных и южных областях России, а также в Беларуси, что подтверждает связь с говорами, где слово «кутырь» было в ходу. В дореволюционных переписях её носители, как правило, относились к крестьянскому сословию, реже — к мещанскому.

Таким образом, предок современных Кутыржиных, скорее всего, получил прозвище за характер или приметную внешность. Фамилия редкая, не попавшая в массовые списки дворянских родов, и её форма сохранила живой отпечаток народной речи.