Основой фамилии Лагутенкова послужило церковное имя Логгин (Лонгин). Логута – производная форма имен Лонгин или Логгин. Это имя восходит к римскому слову longus, что значит «длинный». Впоследствии «о» изменилась на «а» под влиянием произносительной нормы русского языка. Скорее всего, основатель рода Лагутенковых был человеком из простого сословия. Суффикс -енко может указывать на восточно-украинские корни фамилии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Лагута, со временем получил фамилию Лагутенкова.