Фамилия Лифантьев образована от мужского имени Лифантий, производной формы таких старинных имен как Нифонт (с греческого «рассудительный») или Вонифатий (от латинского «творящий благо, добродетельный»). Не исключено, что Лифантий – это форма имени Селифан, просторечного варианта канонического Сильван, которое восходит к латинскому Silvanus – «бог лесов». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Лифантий, со временем получил фамилию Лифантьев.