Фамилия Лобачкова — женская форма от Лобачков, и в её основе лежит не имя, а прозвище, связанное с внешностью. Корень «лоб» указывает на человека с большим, выпуклым или высоким лбом. В русских говорах «лобач» или «лобатый» означало именно широколобого, а уменьшительный суффикс «-ок» (Лобачок) мог относиться к молодому парню или к тому, у кого лоб был скорее заметным, чем огромным. Таким образом, Лобачков — это буквально «сын Лобачка» или «потомок того, кого прозвали Лобачком».

Словообразовательная модель здесь стандартная для русских фамилий: прозвище на -ок (Лобачок) плюс притяжательный суффикс -ов. Переход от Лобачок к Лобачков произошёл по тому же принципу, что и от «Сынок» к Сынков, от «Дружок» к Дружков. Важно не путать с фамилией Лобачёв — там суффикс другой (-ев), и она могла возникнуть от прозвища «Лобач» без уменьшительной формы. Лобачкова же несёт в себе именно оттенок «маленького лобастого» или «сына того, кого звали Лобачком».

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, где слово «лобач» было в ходу. Встречается в Вологодской, Архангельской, Костромской губерниях, а также на Урале — там, где прозвища по внешним чертам были особенно живучи. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Лобачко, что подтверждает народное, недворянское происхождение фамилии.

Среди однокоренных фамилий — Лобов, Лобанов, Лобастов, Лобачёв. Все они описывают одну и ту же приметную черту, но с разными оттенками: Лобов — просто «лоб», Лобанов — «большой лоб», Лобачёв — «лобач», а Лобачков — уменьшительное, возможно, более ласковое или ироничное прозвище. В современных справочниках по ономастике (например, у Б. Унбегауна) такие фамилии относят к группе, образованной от физических особенностей человека — одной из древнейших и самых распространённых.