Фамилия Лягушкина — женская форма фамилии Лягушкин, а та образована от прозвища Лягушка. Вопреки возможному первому впечатлению, в основе лежит не прямое сравнение человека с земноводным, а более конкретные бытовые наблюдения. В русских говорах «лягушкой» могли назвать не только квакающее существо, но и человека с большим ртом, широким лицом, либо того, кто часто сидит на корточках — поза, напоминающая лягушку. Прозвище давали не в насмешку, а как меткую примету.

Словообразовательная модель здесь прозрачна и типична для северных и центральных регионов России: основа «Лягушк-» плюс притяжательный суффикс «-ин». Такие фамилии на «-ин» образовывались от существительных женского рода или личных имён, оканчивающихся на «-а/-я». Сравните: Козин, Сорокин, Бородин. Лягушкин — «чей?» — «сын Лягушки». Суффикс «-к-» в основе может указывать на уменьшительно-пренебрежительный оттенок, но к моменту закрепления фамилии он уже воспринимался как часть корня.

Редкость фамилии — в её прямолинейности. В отличие от фамилий от животных, которые часто маскировались под «птичьи» или «рыбьи» (Соколов, Ершов), Лягушкин стоит особняком: лягушка не была ни промысловым зверем, ни символом. Это значит, что прозвище было очень точным, и его не пытались смягчить или заменить. В ономастических справочниках фамилия не фиксируется как широко распространённая, но встречается в Поволжье и на Урале — там, где сохранилась старая традиция называть человека по характерной черте без оглядки на благозвучие.

Ещё одна версия, менее вероятная, но допустимая: в некоторых говорах «лягушкой» называли торговца лягушачьими лапками или, реже, человека, который лечил болезни, используя лягушек в народной медицине. Однако для фамилии, закрепившейся в крестьянской среде, более правдоподобно бытовое прозвище, а не профессиональное.

Человек с фамилией Лягушкина может считать, что его предки жили в среде, где внешность или повадки ценились выше сословной дистанции — фамилия запомнила живую деталь, а не должность или отчество.