Фамилия Любавичева — женская форма, мужская — Любавичев. Она образована от прозвища или нецерковного имени Любава, что в древнерусском языке означало «милая», «любимая», «желанная». Это имя было распространено в крестьянской и посадской среде до XVII века, пока церковь не начала активно вытеснять неканонические имена.

Словообразовательная модель здесь не самая частая. Суффикс -ич- (в основе Любавич-) указывает на отчество: Любавич — «сын Любавы». А окончание -ев — это уже адаптация под фамильный суффикс, характерный для русских фамилий из западных и южных регионов, где отчества на -ич были нормой (ср. белорусские и украинские фамилии типа Ковалевич, Павлович). В центральной России чаще встречался бы вариант Любавин — от той же основы, но с суффиксом -ин. Таким образом, фамилия Любавичев могла закрепиться на территориях, граничащих с Беларусью или Украиной, либо в среде переселенцев.

В основе — корень люб-, который дал множество фамилий: Любавский, Любавин, Любов, Любимов. Но Любавичев стоит особняком: она не отвлечённая (как Любов), а личная, от имени конкретного человека. Предок носителя, скорее всего, был просто Любавой — так в быту называли ласкового, приветливого или любимого в семье ребёнка. Со временем это прозвище стало фамильным, передавшись детям и внукам.

Встречается фамилия редко. В метрических книгах XIX века её можно найти в южных уездах Рязанской губернии и на Смоленщине — как раз в зоне смешения великорусских и белорусских говоров. Написание с двумя «а» (Любавичев) устойчиво, хотя в дореволюционных записях изредка проскальзывало Любавичов — под влиянием акающего произношения.