Фамилия Магдалишина — одна из тех, что сразу же вызывает ассоциацию с известным библейским именем. Однако прямой связи с Марией Магдалиной здесь нет, а сама фамилия прошла необычный путь образования, который почти не встречается у других русских фамилий.

Основа здесь — женское имя Магдалина, которое в дореволюционной России давали в честь святой. От него образовали притяжательное прилагательное с помощью суффикса -иш- (Магдалишин), а потом добавили фамильный суффикс -а, указывающий на принадлежность женщине. То есть Магдалишина — это форма женского рода от фамилии Магдалишин. Сама же фамилия Магдалишин означает «чей?» — сын или потомок женщины по имени Магдалина. Это редкий случай, когда фамилия образована не от мужского, а от женского имени, что говорит о патронимической (по матери) системе прозвищ, которая иногда встречалась в крестьянской среде, особенно если мать была уважаемой или единственной кормилицей.

Интересно, что суффикс -иш- в фамилиях встречается нечасто. Обычно для образования от женских имён использовали суффикс -ин (Марьин, Аннин). Форма на -ишин (Магдалишин) — более редкая, она подчёркивает мягкость конечного согласного основы (Магдалин-а → Магдалишин). Такая модель встречается в основном в южнорусских и украинских говорах, где фамилии на -ишин (Гаврилишин, Данилишин) — обычное дело. Таким образом, географически фамилия Магдалишина, скорее всего, имеет украинские или южнорусские корни.

Встречается она редко. В дореволюционных метрических книгах её можно найти в южных губерниях Российской империи, например, в Екатеринославской или Херсонской. Носители фамилии — это, вероятно, потомки крестьян или мещан, в чьей семье имя Магдалина передавалось как родовое, или же так прозвали человека, который жил в доме вдовы Магдалины. Версия о происхождении от названия села (например, Магдалиновка) менее вероятна, так как в таком случае фамилия звучала бы как Магдалиновский.

В современной России фамилия Магдалишина остаётся редкой, но её форма отчётливо выдает женское происхождение носителя. Для мужчины фамилия будет Магдалишин.