Имя Макуня представляет собой производную форму имени Максим. Оно имеет древнегреческое происхождение и означает «величайший, огромный». Одним из покровителей этого имени считается христианский монах, богослов и философ Максим Исповедник. Он выступал с борьбой против монофелитской ереси и развивал халкидонское богословие. За свое исповедание Максим был дважды осужден в Константинополе. Во второй раз он был подвергнут пыткам и сослан в Колхиду, где вскоре умер. Спустя 18 лет на Шестом Великом соборе монофелитская ересь была осуждена, а богословие Максима признано соответствующим учению церкви. Возможно также, что имя Макуня является производной формой имен Мокей, которое переводится греческого как «насмешник», и Макар, означающее на греческом «блаженный, счастливый».