Фамилия Маланин, скорее всего, была образована от ласкательного прозвища Маланя, которое родители дали ребенку. В семьях ребенка часто называли просто Малой, Малец или Малыка. Маловероятно, что основой фамилии послужило имя Маланя, которое является производной формой крестильных имен Малахий и Меланья. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Маланя, со временем получил фамилию Маланин.