Фамилия Малкинский — редкий пример того, как в одной словоформе соединились еврейская основа и славянская модель образования. В её основе лежит женское имя Малка, которое восходит к идишскому слову «малка» — «королева, царица». У носителей ашкеназских еврейских общин это имя было распространённым, и от него пошли разные фамилии: Малкин, Малкина, Малкович. Но Малкинский стоит особняком.

Здесь мы видим двойной суффикс: сначала -ин- (отчество первого порядка — «чей?» — Малкин), а затем -ский. Такая конструкция — отчество второго порядка: Малкинский буквально значит «сын Малкина и внук Малки». Суффикс -ский в восточнославянской традиции чаще всего указывал на принадлежность к месту или роду, но в еврейских фамилиях он нередко выполнял роль «облагораживания» — придавал фамилии звучание, похожее на польские или русские дворянские. Поэтому Малкинский — это не топонимическая фамилия (от названия села), а патронимическая, переоформленная по славянскому образцу.

Такая модель сложилась в XIX веке, когда на территориях Российской империи, Украины, Белоруссии и Царства Польского еврейское население массово получало фамилии. Местные чиновники или сами носители нередко добавляли к еврейской основе славянские суффиксы. В случае с Малкинским — добавили -ский к уже существовавшей фамилии Малкин, чтобы выделить ветвь рода или придать фамилии более «приличный» вид для официальных бумаг.

Таким образом, Малкинский — не географическая фамилия, а отчество в два шага. Её носители — потомки человека по имени Малка, чей сын уже носил фамилию Малкин, а внук или правнук стал Малкинским. Эта фамилия встречается реже, чем простая Малкин, и почти всегда указывает на ашкеназское происхождение с корнями в западных губерниях Российской империи или в Польше.