Фамилия Мальковских — яркий пример северорусской модели образования фамилий с помощью суффикса -их/-ых. В центральных и южных регионах России фамилии чаще оформляли через -ов/-ев или -ин, а на Русском Севере, в Сибири и в некоторых областях Поволжья прижилась форма родительного падежа множественного числа: «чей?» — «Мальковских». Это буквально означает «из семьи Мальковых» или «принадлежащий к роду Мальковых». Такая модель указывала на принадлежность к клану или дому, а не к одному конкретному человеку.

Основа фамилии — имя или прозвище Малько. В русской антропонимии это уменьшительная форма от канонического имени Малахия (редко) или, что гораздо вероятнее, от прозвища Малой, Малый, то есть «невысокий человек», «младший в семье», «ребёнок». Суффикс -к- в древнерусских именах часто выполнял ласкательную или уменьшительную функцию, поэтому Малько — это «маленький», «малыш». Таким образом, Мальковских — потомки того, кого в быту звали Малько.

Встречается фамилия в основном в Пермском крае, Кировской области и на Урале — именно там традиция фамилий на -их/-ых сохранилась наиболее стойко. В дореволюционных переписях носители Мальковских числились чаще государственными крестьянами, реже — мещанами. Дворянских ветвей у этой фамилии нет: она однозначно крестьянская по происхождению.

Интересная деталь: ударение в фамилии плавающее. В одних семьях говорят МалькОвских, в других — МальковскИх. Строгой нормы нет, но лингвисты склоняются к варианту с ударением на второй слог — МалькОвских, как более логичному от имени Малько. Впрочем, носители часто сами решают, как им удобнее.