Фамилия Малюковы образована от личного имени Малюка. В старину так могли назвать ребёнка в семье — не как официальное крестильное имя, а как домашнее, ласкательное прозвище. Слово «малюка» напрямую связано с корнем «мал-» и означало «маленький», «кроха». В русских говорах «малюкой» называли и младенца, и просто невысокого человека, причём с оттенком теплоты, а не насмешки.

По словообразовательной модели фамилия относится к самому массовому типу: суффикс -ов присоединился к основе Малюк-, указывая на принадлежность: «сын Малюки». Точно так же появились фамилии Малков, Малютин, Малеев — все они вышли из того же гнезда «малых» имён и прозвищ. Но Малюковы стоят особняком: суффикс -ук- в основе (Малюк-а) встречается реже, чем -ут- или -ей-, и характерен скорее для южнорусских и украинских говоров, где уменьшительные формы на -ук, -юк особенно распространены.

В документах XVI–XVII веков имя Малюка не редкость. Например, в переписных книгах встречаются крестьяне и посадские люди с таким именем — без фамилии, просто Малюка. Значит, фамилия Малюков могла возникнуть независимо в разных регионах: везде, где жил человек по прозвищу Малюка, его дети становились Малюковыми.

Есть и вторая, менее вероятная версия: от тюркского имени Малюк (в значении «царь», «владыка»). Но для русской фамилии она слабая — в быту такое имя почти не фиксируется, а звучание и смысл «маленького» куда естественнее для простонародной среды.

Точную дату появления фамилии назвать нельзя: крестьянские фамилии в центральной России закрепились в основном к XVIII–XIX векам. Но сама основа Малюка — древняя, и фамилия Малюковы — не случайный, а живой след того, как в русской семье называли самого младшего или любимого малыша.