Фамилия Манилич образована от прозвища Манила. На Руси так нередко называли того, кто манит, выманивает — обманщика и плута. Глагол «манить» в этом значении был широко распространён: манил тот, кто завлекал обещаниями, но не выполнял их. Однако есть и другая версия, связанная с украинским языком. В нём глагол «манити» означает не столько обманывать, сколько кивать или подавать знак. С этой точки зрения Манилой могли прозвать льстеца или человека, который со всеми соглашается, кивает в ответ.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для восточнославянских фамилий. К основе Манил- добавился суффикс -ич, указывающий на происхождение: «сын Манилы». В белорусской и украинской традиции такие фамилии на -ич встречаются чаще, чем в великорусской, где преобладали -ов и -ин. Это даёт основание предполагать, что фамилия Манилич имеет скорее западнорусские или украинские корни.

Географически фамилия редкая. В современных справочниках она не относится к числу распространённых, что говорит о локальном бытовании в прошлом. Скорее всего, предок носителя фамилии жил в одном из регионов, где была сильна традиция прозвищ на -ила (Манила, Колеснила, Плаксила и т.п.). Такие прозвища давали по характерной черте поведения или привычке, и они легко закреплялись за родом.

Таким образом, потомок человека по прозвищу Манила со временем получил фамилию Манилич. В зависимости от того, какое значение вкладывалось в прозвище изначально, предок мог быть либо хитрецом и обманщиком, либо льстивым человеком, который старался угодить. Оба варианта правдоподобны, но первая версия — от прямого значения «манить, обманывать» — выглядит более вероятной, поскольку она шире представлена в русских говорах и документах XV–XVII веков.