Фамилия Манойло образована от крестильного мужского имени Иммануил, распространенного в старину. В переводе с древнееврейского это имя означает «с нами Бог». Возможно, что в основу фамилии легло прозвище Манойло (Мануйло), которое дали льстецу и обманщику.