Фамилия Манжелий — редкая, и её происхождение напрямую связано с этнической историей Центральной Азии. В основе лежит тюркское слово «манжули» — так называли каракалпаков, входивших в племя ктай. Предок, получивший это прозвище, мог либо сам принадлежать к этой группе, либо жить среди манжули, то есть в среде, где это название было на слуху. Таким образом, фамилия Манжелий — не от имени и не от ремесла, а от этнонима, что сразу выделяет её среди множества русских фамилий на -ий.

В русской традиции фамилии на -ий (как Манжелий, Борзенко, Лисовский) чаще всего указывают на польское или украинское влияние, но здесь случай иной. Суффикс -ий в данном контексте мог появиться при русификации тюркского прозвища: исходное «Манжули» превратилось в «Манжелий» по аналогии с фамилиями прилагательного типа (вроде «долгий», «широкий»). Встречается и вариант написания Манжулий — он ближе к исходному звучанию.

Географически фамилия Манжелий привязана к южным регионам бывшей Российской империи: Казахстану, Каракалпакстану, Нижнему Поволжью. В этих местах тюркские и монгольские племенные названия нередко становились фамилиями оседлых или полукочевых семей. Маловероятно, что Манжелий — искусственная семинарская фамилия (как, например, Преображенский): в ней нет церковнославянской основы, а есть живое прозвище, которое давали со стороны.

Если рассматривать альтернативные версии, то встречается предположение, что корень «манж» связан с китайским или маньчжурским словом (ср. «маньчжур»), но эта гипотеза слабая: фонетически «манжули» стоит ближе к каракалпакской среде, чем к маньчжурской. Поэтому основная и самая правдоподобная версия — именно племенное прозвище.

Носители фамилии Манжелий сегодня рассеяны: единичные семьи встречаются в России (Оренбургская область, Башкортостан), на Украине и в Казахстане. Это не частая фамилия, и её носители, скорее всего, потомки тех, кто в XIX веке перешёл от родового имени к фамилии по отцу: «Манжелий» буквально означало «сын (или потомок) того, кого звали Манжули». В метрических книгах и ревизских сказках эту фамилию стоит искать среди казаков или крестьян южных уездов.