Фамилия Мареин — одна из тех, где прозрачная на первый взгляд основа таит в себе неожиданный поворот. На слух она кажется «морской» (от «море»), и это первое, что приходит в голову. Однако русская ономастика здесь корректирует интуицию: притяжательный суффикс -ин указывает на происхождение от личного имени или прозвища, а не от географического объекта. Если бы предка прозвали «Морским» за связь с морем, фамилия звучала бы как Морской или Морсков (с суффиксом -ск-). Мареин же образована напрямую от имени Марей.

Марей — это народная, разговорная форма крестильного имени Марий (от римского родового имени Marius). В святцах это имя встречается редко, поэтому в крестьянской среде его могли давать в честь святого Мария, а в быту сокращали до Марей. Другая версия — отчество от прозвища Марей, которое мог получить человек с тихим, «маревым» нравом (от диалектного «мара» — марево, туман, дымка). Но это предположение слабее: прозвищная основа «мара» в русских фамилиях обычно даёт Маров или Марин, а не Мареин.

Фамилия редкая и географически привязана к центральным областям России, где было распространено имя Марий. Встречается также вариант Мареев — с более типичным суффиксом -ев, который ставится после мягких согласных. Мареин же сохранил архаичное окончание, указывающее на прямую отцовскую форму: «чей?» — Мареин, то есть сын Марея. По сословному составу носители фамилии в XIX веке — преимущественно государственные крестьяне и мещане, реже однодворцы южных губерний.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Мареин стоит особняком. Мареев, Мариин, Марьев — все они восходят к тому же имени Марий, но через разные суффиксы. Мареин — самый короткий и прямой вариант, без лишних наращений, что выдает его раннее происхождение: такие фамилии часто закреплялись за одним родом ещё в XVI–XVII веках, когда отчество ещё не стало наследственным, а было живым указанием на отца.