Фамилия Марфутина — один из тех случаев, когда без разбора женской формы не обойтись. На слух она звучит как типичная «матронимическая» фамилия, то есть образованная от женского имени. И это действительно так: в основе лежит имя Марфа (каноническая форма Марфа, разговорная Марфа). Суффикс -ин указывает на принадлежность: Марфутин — значит «сын Марфуты» или «человек из семьи Марфуты».

Но почему не Марфин? Здесь и кроется главная особенность. В русских говорах, особенно северных и северо-восточных, было распространено образование уменьшительно-ласкательных форм женских имён с суффиксом -ут(а): Марфута, Аннута, Дарьюта. Соответственно, отчество или прозвище звучало не как «Марфин сын», а как «Марфутин сын». Со временем «сын» отпал, а форма на -ин закрепилась как фамилия. Таким образом, Марфутина — это не вариант фамилии Марфин, а её параллельная, диалектная ветвь, сохранившая более архаичную словообразовательную модель.

Исходное имя Марфа — древнееврейского происхождения, означает «госпожа», «хозяйка». В крестьянской среде, где фамилии часто давали по имени матери (особенно если отец умер или был неизвестен), Марфа и её производные были распространены. Носительница фамилии Марфутина по мужской линии — потомок женщины по имени Марфа (или Марфута), что в патриархальном обществе XIX века было необычным, но вполне реальным фактом биографии семьи.

Фамилия редкая и территориально привязана. Она почти не встречается в центральных областях, зато фиксируется в старых переписях Вологодской, Архангельской и Пермской губерний — как раз в зоне бытования суффикса -ут(а). Если ваши предки Марфутины, скорее всего, они были государственными крестьянами Русского Севера или Прикамья.

В написании путаница бывает редко, но стоит помнить: правильная форма — с буквой «и» в окончании, так как фамилия склоняется по типу прилагательного (Марфутина, Марфутиной). Вариант «Марфутин» (мужской) существует, но женская форма Марфутина закрепилась как основная, что тоже говорит в пользу матронимического происхождения: фамилию давали по матери, а не по отцу.