Фамилия Марфутова — яркий пример того, как редкая календарная форма имени стала основой для фамилии. В её основе лежит женское имя Марфа, но не напрямую, а через уменьшительно-ласкательный вариант Марфута. Такая модель образования (основа + суффикс -ут-) характерна для северных и северо-западных говоров, где -ут-/-ют- придавали имени оттенок ласки или принадлежности к младшему члену семьи. Сравните: Ванюта, Петрута, Аннута.

Поскольку фамилия образована от женского имени, это почти наверняка указывает на особый путь её возникновения. В русской традиции фамилии на -ин от женских основ обычно давали детям, чей отец был неизвестен или умер рано, либо в ситуациях, когда мать играла главную роль в хозяйстве (так называемые «материнские» фамилии). Марфутовы — потомки женщины по имени Марфа, которую в быту звали ласково Марфутой. Имя Марфа (от арамейского «госпожа, хозяйка») было очень популярно в купеческой и крестьянской среде до XIX века, поэтому фамилия, хоть и редкая, встречается в нескольких регионах.

Географически фамилия тяготеет к центральным областям России и Поволжью. Встречается она и в казачьих станицах, что неудивительно — имя Марфа было одним из самых распространённых среди донских и кубанских казачек. Интересно, что у фамилии есть «двойник» с тем же корнем, но иной суффиксальной моделью — Марфунин, образованный от формы Марфуня. Марфутова же звучит архаичнее, сохраняя редкий суффикс, который в современном русском языке почти исчез из активного словообразования.

Если говорить о социальном контексте, то носители фамилии почти наверняка были крестьянами или мещанами. Дворянские роды с такой фамилией в истории не зафиксированы. Сама фамилия не подверглась переосмыслению: её этимология прозрачна, никаких тюркских или финно-угорских корней за ней не числится. Это чисто русская, народная фамилия, в которой слышен говор и быт старой деревни.