Фамилия Маргорян — армянская, что сразу видно по суффиксу -ян, одному из самых распространённых окончаний армянских фамилий. Он означает принадлежность к роду, происхождение: буквально «из дома такого-то» или «потомок такого-то». В русской передаче часто пишется как -ян, хотя в оригинале может быть -յան. Так что Маргорян — это «из рода Маргора» или «потомок Маргора».

Основа фамилии — личное имя или прозвище Маргор. В армянском языке это слово имеет два возможных корня. Первый: «марг» (մարգ) — луг, поле, то есть Маргор могло означать «луговой», «живущий у луга». Второй вариант: «марг» в значении «пророк» (от древнеперсидского или сирийского влияния). Тогда Маргор — уменьшительная или уважительная форма, вроде «пророчек» или «маленький пророк». В армянской ономастике имена с корнем «марг» встречаются, но не массово, что делает фамилию относительно редкой.

С географической точки зрения фамилия Маргорян тяготеет к западным регионам исторической Армении — к области Васпуракан (современный восток Турции, район озера Ван) и к Киликии. После геноцида армян в начале XX века носители фамилии расселились по диаспоре: в Ливане, Сирии, Франции, США, а позже — и в России. В современной Армении фамилия встречается, но не входит в число самых частых.

Социальный контекст: суффикс -ян в армянских фамилиях не указывал на сословие — его носили и крестьяне, и ремесленники, и духовенство. Поэтому предки Маргорян могли быть земледельцами (если корень «луг») или людьми, связанными с религиозной традицией (если «пророк»). Без дополнительных генеалогических записей точнее сказать сложно, но оба варианта правдоподобны.

Сравнение с однокоренными фамилиями: в армянском языке есть фамилии Маргарян (от имени Маргар — «жемчужина», это другой корень) и Маргосян (от Маргос — греческое «Марк»). Маргорян стоит особняком: ни с «жемчугом», ни с Марком она не связана, а представляет собой отдельную линию, возможно, локальную. Для носителя фамилии это хороший повод изучить семейные предания — именно в них может сохраниться ключ к тому, какой из корней был исходным.