Оно, скорее всего, этимологически связано с белорусским прилагательным «маркотны», то есть «печальный, грустный». Вполне вероятно, что это прозвище являлось внутрисемейным. В таком случае оно выполняло «охранительную» функцию и использовалось в качестве оберега. В данном случае, надеясь иметь веселого и жизнерадостного мальчика, родители назвали его Маркатуном. Согласно другой, менее вероятной гипотезе, прозвище Маркатун ведет свое начало от глагола «маракаваць», то есть «соображать, размышлять». Исходя из этого, можно предположить, что родоначальник фамилии Маркатун был вдумчивым человеком.