Фамилия Маркитановы (в мужском варианте — Маркитанов) происходит от прозвища Маркитан, которое в XVIII–XIX веках закрепилось за мелкими торговцами, сопровождавшими армию. Маркитанты продавали солдатам продовольствие, табак, предметы обихода — словом, всё, что требовалось в походе и на учениях. В русской армии их права начали регулировать уставом 1716 года, и просуществовала эта профессия до начала XX века. Прозвище, таким образом, прямо указывало на род занятий предка: это не личное имя, а «профессиональное» именование по типу «Кузнец» или «Плотник».

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: к основе Маркитан- добавили суффикс -ов, означающий «сын» или «потомок» (Маркитанов буквально — «сын Маркитана»). Это одна из самых распространённых моделей русских фамилий, но сама основа встречается нечасто, что делает фамилию заметной.

Интересно, что прозвище Маркитан — калька с итальянского mercante («торговец»), пришедшая в русский язык через польское посредничество. В отличие от однокоренных фамилий вроде Маркитантов (с ударением на втором слоге), здесь ударение падает на третий слог — Маркита́нов, что тоже может указывать на региональные особенности произношения. Говорить о точном месте возникновения фамилии сложно: процесс становления фамилий растянулся на столетия, и документальных свидетельств о первом Маркитанове пока не найдено. Но профессиональная основа прозвища не оставляет сомнений в том, что предок носителя фамилии кормился торговлей при армии.