Фамилия Марутовы образована от личного прозвища, и её происхождение, как у многих русских фамилий, допускает несколько толкований. Самая прямая версия связывает основу «Марут» с глаголом «марать»: в этом случае Марутой называли неаккуратного, пачкающегося человека. Однако есть и более неожиданный поворот. В языке офеней — бродячих торговцев, у которых был собственный тайный говор, — словом «марушка» обозначали гривну, то есть денежную единицу. Если прозвище возникло в этой среде, то Марутой могли прозвать бережливого или, наоборот, богатого купца. Менее вероятна версия, возводящая фамилию к женскому имени Мария (от древнееврейского «любимая, желанная; госпожа») через его просторечную форму Марута — так могли назвать сына или внука женщины по имени Марута, но это скорее исключение, чем правило. Фамилия закрепилась по типичной русской модели: суффикс -ов указывает на принадлежность потомку человека с прозвищем Марута. Точное место и время возникновения фамилии Марутовы установить сложно — процесс становления фамилий был долгим, и такие прозвища могли появиться в разных регионах независимо друг от друга. Что примечательно, фамилия не слишком распространена, что делает её редким свидетельством либо локального диалектного слова, либо профессионального жаргона офеней, который почти исчез из живого языка.