Фамилия Марыш — редкий пример, где фамилия образована напрямую от прозвища с помощью суффикса, который почти не встречается в русской модели. В отличие от массовых -ов и -ин, суффикс -ыш характерен для западнославянских языков, особенно польского и чешского. В польском суффикс -ysz (читается как «-ыш») образует уменьшительные или прозвищные формы от имён: Марыш — это, скорее всего, вариант имени Марек или Мария, а точнее — от польского уменьшительного Марысь (Maryś), которое в русской записи превратилось в Марыш.

Если же исходить из русской народной традиции, основа могла быть другой. В говорах «марыш» — это диалектное название мелкой рыбы (например, мойвы или снетка) в северных и волжских областях. Прозвище Марыш могли дать рыбаку, торговцу рыбой или человеку невысокого роста, которого сравнивали с мелкой рыбёшкой. Такая версия менее вероятна, потому что фамилия почти не встречается в центральных русских губерниях, а на западе — в Смоленской, Брянской областях, в Беларуси — она более типична, что указывает на польское влияние.

Словообразовательная модель проста: основа Мары- (от имени или прозвища) + суффикс -ш. В русском языке такой суффикс даёт фамилии без окончания (Марыш склоняется как существительное мужского рода с нулевым окончанием). Это нетипично для исконно русских фамилий, которые обычно имеют окончание -ов, -ев или -ин. Фамилия Марыш — одна из тех, что осталась в форме «чистого» прозвища, не обработанного стандартными фамильными суффиксами.

География фамилии узкая: единичные носители встречаются в Польше, в западных областях Украины и Беларуси, а в России — преимущественно на юге (Краснодарский край, Ростовская область), куда переселенцы принесли фамилию в XIX–XX веках. В переписных книгах XVII века фамилия не зафиксирована, что подтверждает её позднее происхождение — скорее всего, не раньше XVIII века.

Сословная принадлежность предков-носителей фамилии Марыш не прослеживается: в дворянских родословных книгах она не значится, а значит, предки были либо крестьянами, либо мещанами. Точных сведений о первом носителе нет, но если опираться на западнославянскую версию, то предок мог быть выходцем из польской шляхты, чья фамилия упростилась при записи в русские документы.