Фамилия Масалитова — женская форма фамилии Масалитов, и её разбор стоит начать с неочевидного на первый взгляд корня. В основе лежит слово «масал» или «масала» — в тюркских языках (особенно в башкирском, татарском, казахском) это «приправа», «смесь», а в переносном смысле — «толк», «смысл», «суть». Однако напрямую прозвище «Масала» вряд ли дали бы повару: скорее, так могли назвать человека рассудительного, «с толком», или же того, кто любил прибавлять в разговоре «масал» — то есть говорить с присказками, прибаутками, смаком.

Суффикс -ит- в фамилии Масалитов — редкий для русских фамилий, но встречающийся в тюрко-славянском пограничье. Он мог быть заимствован из тюркских моделей (где -ит/-ыд — показатель принадлежности) или же возник на русской почве как вариант адаптации: от прозвища Масала образовали притяжательное прилагательное «Масалитов», то есть «сын Масалы». Финаль -ов — стандартный русский патронимический суффикс, закрепивший фамилию за родом.

Географически фамилия тяготеет к южному Уралу и Зауралью: Башкортостан, Челябинская, Оренбургская области. В этих краях фамилии на -итов характерны для потомков башкир, татар или мишарей, перешедших в православие или живших в смешанных сёлах. Предки Масалитовых, вероятно, были либо крестьянами-земледельцами, либо служилыми людьми из «инородцев», нёсшими сторожевую службу на границе.

Встречается вариант написания с одной «с» — Масалитов, а также с ударением на второй слог: Маса́литов. Второй вариант ближе к тюркскому произношению, где ударение падает на «а» в корне. Сама фамилия не относится к числу частых, но и не является единичной — её носители встречаются в документах переписей XIX века среди крестьян Уфимской губернии.