Фамилия Матушек — редкий для России пример фамилии, образованной по чешской или словацкой модели. В славянском мире суффикс -ек (-ek) выполняет ту же уменьшительную роль, что русский -ок или украинский -ко. Таким образом, Матушек — это уменьшительная форма от имени Матуш, которое является местным вариантом библейского имени Матфей (чеш. Matouš, словац. Matúš). Дословно фамилию можно перевести как «маленький Матфей» или «сын Матфея». В русском языке эта фамилия иноязычная, её не следует путать с исконными фамилиями на -ушев или -ушин.

Географически фамилия Матушек распространена в Чехии и Словакии, а в России встречается у потомков переселенцев из этих регионов, особенно на юге страны и в Сибири, куда в XIX веке направлялись колонисты. В отличие от русских фамилий, где суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность отцу, западнославянский формант -ек фиксирует скорее прозвищную или ласкательную форму, которая затем закрепилась как наследственная.

Интересная деталь: в чешской ономастике фамилия Матушек могла возникнуть не только от имени, но и от прозвища, связанного с календарным днём святого Матфея. В аграрной среде человека, родившегося или крещёного под этот праздник, могли прозвать Матушком, и прозвище переходило к детям. Эта версия менее вероятна, но встречается в работах по западнославянской антропонимии.

Сравните с однокоренными фамилиями: Матуш (без суффикса), Матушак (с другим уменьшительным суффиксом), а также русифицированными вариантами Матушов и Матушев. Фамилия Матушек стоит особняком — её окончание не даёт спутать её с русской фамилией и сразу указывает на западное происхождение рода. В дореволюционных документах она могла записываться на слух как Матушок или Матушэк, но современное написание закрепилось в форме Матушек.