Фамилия Матушенко — типичный пример украинской модели образования фамилий на -енко. По-украински эта модель означает «сын» или «потомок», то есть Матушенко — буквально «сын Матуша». Вопрос в том, кто такой Матуш.

Матуш — это народная, разговорная форма имени Матвей. Полное церковное имя Матфей (от древнееврейского «дар Яхве») в обиходе на Украине и в южнорусских землях часто превращалось в Матуш, Матюш или Матяш. Суффикс -енко, самый распространённый в украинской антропонимии, крепко прирос к этой основе. Получается, что Матушенко — это «Матвеич» или «Матвеев сын», только по-украински.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых говорах «матуш» могло быть прозвищем, данным за сходство с матушкой — то есть ласковым, мягким или, наоборот, женоподобным человеком. Однако в контексте фамилий, образованных от крестильных имён, первая версия выглядит гораздо убедительнее. На Украине фамилии на -енко от имён — вещь массовая: Иващенко, Петренко, Гриценко, и Матушенко стоит в том же ряду.

Географически фамилия распространена преимущественно на востоке и в центре Украины, а также среди потомков переселенцев на Кубани и в южных областях России. Встречается и в Беларуси, но реже. В дворянских родословных книгах Матушенко не отмечены — это фамилия казацкой и крестьянской среды, где отчество в форме -енко стало наследственным прозвищем ещё в XVII–XVIII веках.

Интересная деталь: в русских переписях XIX века фамилию часто записывали на слух, поэтому можно найти варианты «Матушенков» или «Матушонко» — это просто адаптация украинского звучания под русскую грамматику. Но исходная форма остаётся именно Матушенко, с ударением на второй слог.