Фамилия Матушин — относительно редкая, но её происхождение прозрачно, если знать, как работали русские суффиксы. В основе лежит имя Матуша — уменьшительная форма от канонического имени Матвей (древнееврейское Матфей — «дар Яхве»). Модель простая: к основе Матуш- добавили типичный притяжательный суффикс -ин, означающий «чей?» — «сын Матуши», «Матушин сын».

Интереснее здесь сам суффикс -уш-: в русской народной традиции он придавал имени ласкательный или фамильярный оттенок (сравните: Ванюша, Петруша, Микуша). Поэтому Матуша — это не просто «маленький Матвей», а скорее «Матвей, которого дома звали ласково». Фамилия закрепилась в форме Матушин, а не Матушев, что указывает на её северный или центрально-русский ареал: суффикс -ин типичен для земель Новгородской и Ростово-Суздальской традиции, где окончание -ов/-ев было менее распространено.

Встречается и альтернативная версия: от прозвища Матуша, связанного с диалектным глаголом «матусить» — в некоторых говорах так называли человека, который суетится, мельтешит или делает что-то невпопад. Но эта гипотеза слабее, так как прозвищная основа «матус-» фиксируется редко, а имя Матвей в крестьянской среде было очень популярно — до революции оно входило в десятку самых частых мужских имён.

Документальных упоминаний о дворянском происхождении Матушиных нет — скорее всего, это фамилия крестьянская или мещанская. В XIX веке носители фамилии встречались в Тверской, Ярославской и Вологодской губерниях, что подтверждает привязку к северо-восточным землям. Сегодня фамилия остаётся немногочисленной, но её носители есть и в России, и в странах бывшего СССР — в основном потомки тех самых тверских и вологодских крестьян.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Матвеев, Матюшин, Матусевич, — то Матушин стоит особняком из-за редкого суффикса -уш-: он не так широко использовался в официальной записи, как -юш- (Матюша → Матюшин), поэтому каждая такая фамилия — маленькая лингвистическая редкость.