Фамилия Мирягин образована от прозвища или нецерковного имени Миряга. В её основе лежит слово «мир» в одном из двух значений: либо «спокойствие, тишина» (мирный человек), либо «община, народ» (крестьянин-общинник, мирянин). Суффикс -яг- в русских прозвищах — экспрессивный, он придавал слову оттенок просторечия и фамильярности: Миряга — «тихоня» или «человек из мира, свой». По модели образования фамилия типична для северных и центральных областей России: суффикс -ин указывает на принадлежность «сын Миряги», как у фамилий Кузягин, Борягин.

Вторая версия, менее вероятная, связывает основу с диалектным глаголом «мирять» (мирить, улаживать ссору). Тогда Миряга — это миротворец, тот, кто разнимает драчунов. Но в ономастике чаще фиксируются прозвища по характеру, а не по действию, поэтому версия «мирный» или «общинный» выглядит убедительнее.

Фамилия редкая. В дореволюционных переписях она встречается в основном в Вятской и Костромской губерниях — на территориях, где было сильно крестьянское общинное самоуправление. Мирягами там могли называть не просто спокойных людей, а активных членов «мира» — сельского схода. Вариант написания с буквой «и» в корне (Мирягин, а не Мерягин) закрепился ещё в XVII веке, что видно по писцовым книгам, где упоминаются крестьяне Мирягины из-под Галича.

Однокоренные фамилии — Миряев, Миряков, Мирясов — образованы от той же основы, но с другими суффиксами. Мирягин стоит особняком: суффикс -яг- сегодня почти не используется в новых фамилиях, что делает её архаичной и локальной. Носителей этой фамилии в современной России — единицы, и почти все они сосредоточены в Кировской области и Пермском крае, что подтверждает её вятские корни.