Фамилия Моджина — редкая, и её происхождение неочевидно. Скорее всего, перед нами патронимическая фамилия, образованная от прозвища или имени с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Моджин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Моджа.

Самая вероятная версия связывает основу с диалектным словом «моджа» или «можа». В южнорусских и украинских говорах «моджа» могла означать грязь, слякоть, топкое место, а иногда — неопрятного, неряшливого человека. В этом случае прозвище Моджа дали бы либо человеку, который жил у болота или грязного пруда, либо тому, кто ходил нечистым. Суффикс -ин в таких фамилиях типичен для северных и центральных областей России, но сама лексема «моджа» — скорее южного происхождения, что говорит о возможном смешении диалектных зон или миграции предков.

Менее распространённая, но допустимая гипотеза — итальянское влияние. Фамилия Моджина (Moggina) встречается в Италии, особенно в Ломбардии и Пьемонте, где она может быть связана с топонимом Моджа (Moggia) или уменьшительной формой от имени Моджио. В русском контексте такая фамилия могла появиться у обрусевших итальянцев, например, архитекторов или мастеров, приезжавших в Россию в XVIII–XIX веках, но массового распространения эта версия не получила: фамилия слишком редка в русских архивах.

В написании «Моджина» стоит обратить внимание на букву «дж» — это нехарактерное для исконно русских фамилий сочетание. В русских говорах «дж» чаще передаёт аффрикату, близкую к звуку [дж], что могло возникнуть при заимствовании из тюркских или кавказских языков. Теоретически, основа могла быть связана с тюркским «моджа» (например, в значении «учитель» или «наставник» — от арабского «муджа»), но для фамилии Моджина такая связь остаётся лишь гипотезой без надёжных документальных подтверждений.

В целом, носитель фамилии Моджина может с наибольшей вероятностью считать своими предками выходцев из южнорусских или украинских земель, где прозвище Моджа давали по месту жительства или внешнему виду. Итальянский след не стоит исключать, но он менее вероятен из-за отсутствия массовых переселений и редкой встречаемости фамилии в исторических документах.