Фамилия Мокшеев — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а этноним, да ещё и с неочевидной историей. Разбираем её по косточкам.

Корень «мокш-» прямо указывает на мокшу — одну из двух основных этнических групп мордвы (вторая — эрзя). Мокшане издавна живут на западе Мордовии, в бассейне реки Мокши, и говорят на мокшанском языке. Но фамилия Мокшеев не обязательно означает, что предок был мокшанином по крови. Скорее всего, это прозвище: «Мокшей» на русских землях могли называть человека, который пришёл из мокшанских земель, говорил с характерным акцентом или перенял какие-то черты мокшанского быта. В XVI–XVII веках, когда русское государство активно осваивало Поволжье, такие прозвища были обычным делом — по ним опознавали «чужаков» из соседних народов.

Суффикс «-еев» — это вариант фамильного суффикса «-ев», который присоединяли к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или на «й» (в старом написании «Мокшей» даёт «Мокшеев»). По модели образования фамилия типична для русского крестьянства и мещанства: от прозвища или этнонима через притяжательное прилагательное («чей?» — Мокшеев, то есть сын Мокшея). В дворянской среде такие фамилии встречаются реже, но в целом сословной привязки у неё нет — Мокшеевы могли быть и государственными крестьянами, и однодворцами, и казаками.

Географически фамилия тяготеет к регионам, граничащим с Мордовией: Нижегородская, Пензенская, Тамбовская области, а также юг Рязанской. Встречается она и в самой Мордовии, но там чаще фиксируются мокшанские фамилии на «-кин» или «-айкин» (например, Мокшайкин). Мокшеев — это именно русская по форме фамилия, образованная от мокшанского корня.

Есть и более спорная версия: связь с рекой Мокшей. Но гидронимы редко дают прямые прозвища без дополнительного суффикса (обычно было бы «Мокшин» или «Мокшанский»). Поэтому версия с этнонимом надёжнее — она подтверждается типовой моделью прозвищ для выходцев из других народов: Татаринов, Чувашев, Мордвинов, Мокшеев.

Итог: предок носителя фамилии Мокшеев, скорее всего, был русским по языку и культуре, но получил прозвище по связи с мокшанским миром — либо по месту жительства среди мокшан, либо по внешним признакам, которые окружающие считали «мокшанскими». Фамилия не древняя (массово такие прозвища закрепились в XVII–XVIII веках), но сохранила память о межэтнических контактах на юго-восточной окраине Московского государства.