Фамилия Молокитин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не скрывается за суффиксами. Корень здесь прозрачен: «молоко» или «молокита». Последнее слово в старых говорах означало не просто любителя молока, а человека, который не прочь поживиться чужим добром, прихватить что плохо лежит, то есть мелкого воришку или хапугу. В словаре Даля «молокита» — это именно «плут, обирала», а не кроткий молочный человек. Так что первый носитель фамилии, скорее всего, получил своё прозвище за не самую лестную черту характера или поведения.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Молокитин — это «сын Молокиты» или «человек из семьи Молокиты». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а, -я. Интересно, что фамилия встречается в двух вариантах написания: Молокитин и Молокитен. Второй вариант, с «е» в суффиксе, — следствие акающего произношения, распространённого в южнорусских и некоторых среднерусских говорах, где безударное «и» звучит как «е». Это даёт географическую зацепку: предки Молокитиных могли жить в регионах с таким говором — например, в Рязанской, Тамбовской или Воронежской губерниях.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Молоков, Молочников, Молоканов — показывает разницу в социальном контексте. Молоков и Молочников почти наверняка связаны с профессией продавца молока или скотовода, а Молоканов — с производством молокана (кислого напитка). Молокитин же стоит особняком: его основа — не ремесло, а личная характеристика, причём неодобрительная. Такие прозвища давали не для похвальбы, а для меткого узнавания человека в деревне. Со временем прозвище закрепилось как фамилия, и потомки уже не вкладывали в неё первоначальный смысл.

Документальных свидетельств о древности фамилии мало, но модель образования — отчество от прозвища на -а — типична для XVI–XVII веков, когда на Руси активно формировались фамилии у крестьян и посадских людей. В более ранних источниках, например в актах XV века, встречаются похожие прозвища вроде Молокита, но без фамильного суффикса. Так что Молокитин — фамилия, скорее всего, поздняя, крестьянская, и её история — это история бытового, непарадного прозвища, которое стало родовым именем.