Фамилия Молокитина — редкий случай, когда женская форма закрепилась в документах раньше мужской, а сама основа вызывает больше вопросов, чем ответов. В официальных списках и базах данных эта фамилия почти всегда фигурирует в женском роде, что наводит на мысль: либо её носительницы составляли большинство в переписях, либо исходная мужская форма «Молокитин» была вытеснена из-за особенностей местного говора или канцелярской ошибки.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность к лицу, названному основой. То есть Молокитина — буквально «жена или дочь Молокиты». Но кто такой Молокита? Вариантов два, и оба неочевидны. Первый — прозвище от глагола «молотить» с диалектным чередованием т/к (молотить — молокита). В таком случае предок мог быть молотильщиком, работником на току, человеком с тяжёлой физической работой. Второй, более сомнительный, — связь с прилагательным «молокий» (вялый, медлительный), но эта версия не подкреплена ни словарями, ни живыми говорами.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодчине, Костромской и Нижегородской землям. В этих краях, по данным региональных ономастических справочников, фамилия встречается единичными гнёздами, а не массово. Это говорит о том, что она не пошла от боярского рода или служилых людей, а возникла в крестьянской или ремесленной среде и осталась локальной.

Если сравнивать с однокоренными: фамилия Молотилин (от «молотило») встречается чаще и понятнее по смыслу. Молокитин же — более архаичный вариант, сохранивший диалектное произношение. Возможно, в основе лежит не глагол, а прозвище Молокита, образованное от «молоко» с суффиксом -ит(а) по модели «работяга» или «гуляка». Тогда это могло быть ироничное именование человека, связанного с молочным делом — пастуха, дояра или торговца молоком.

В итоге: Молокитина — фамилия с неоднозначной, но живой этимологией. Самый вероятный след ведёт к прозвищу от «молотить» с местным чередованием звуков. Носители фамилии — потомки крестьян или ремесленников из северных губерний, чьё прозвище закрепилось в редкой женской форме.