Фамилия Мошкара — один из тех редких случаев, когда за основу взято не личное имя или профессия, а собирательное существительное. В русских говорах «мошкара» — это мелкие летающие насекомые, гнус, мошка. Прозвище Мошкара могли дать человеку маленького роста, суетливому или дотошному, который «вьётся» вокруг дела, как мошкара. В некоторых диалектах слово имело и переносное значение — «мелкий, назойливый человек», так что фамилия могла закрепиться за тем, кто обладал беспокойным характером.

С точки зрения словообразования фамилия уникальна: суффикс -а здесь не фамильный (как, например, в фамилиях на -ов/-ев), а входит в основу исходного нарицательного слова. Это значит, что фамилия образовалась не по стандартной модели «прозвище + суффикс принадлежности», а путём прямого переноса прозвища в фамилию без добавления типичных окончаний. Такое явление встречается редко и характерно скорее для украинской или белорусской ономастики, где фамилии на -а без суффиксов более распространены. В русской среде подобные фамилии (например, Муха, Комар) обычно оформлялись иначе — через суффиксы, поэтому Мошкара может указывать на западнорусские или южнорусские корни рода.

Споров вокруг происхождения фамилии почти нет, но стоит упомянуть одну гипотезу: в некоторых говорах «мошкара» называли не только насекомых, но и мелкую рыбу (мальков). Если предок был рыбаком или жил у воды, прозвище могло относиться к его промыслу. Однако эта версия менее убедительна, так как в письменных источниках такое значение фиксируется редко, а основное — «гнус» — повсеместно.

Географически фамилия рассеяна, но чаще встречается в центральных и южных областях России, а также на Украине. В дореволюционных переписях Мошкара не была распространена среди дворянства — скорее всего, это фамилия крестьянская или мещанская. Известных исторических носителей с этой фамилией не зафиксировано, что типично для прозвищных фамилий, не связанных с известными родами. Если у вас фамилия Мошкара, ваши предки, вероятно, жили в сельской местности, и прозвище им дали за внешность или характер — без обидного оттенка, а скорее с бытовой меткостью.