Фамилия Мухалане — редкий случай, когда корень не поддаётся однозначному толкованию в рамках привычных русских или тюркских моделей. На слух она напоминает грузинские или западно-кавказские фамилии на -ани, -ане, где суффикс указывает на принадлежность к роду или местности: ср. Гудаване, Дадиани. Однако основа «Мухал» в таком контексте неочевидна. В грузинском есть слово «муха» (муха́) — «дуб», и фамилия могла означать «дубовый» или «живущий у дуба», но это лишь гипотеза, не подкреплённая частотностью.

Другая версия отсылает к арабскому или тюркскому имени Мухаммад в его диалектных формах (Мухала, Мухали). В таком случае фамилия могла образоваться через прибавление суффикса -не, что характерно для молдавских или украинских фамилий (ср. Драгане, Стефане), где -не — это указание на сына или выходца. Тогда Мухалане — «сын Мухала», то есть потомок человека по имени Мухала (усечённая форма от Мухаммед). Эта версия объясняет и редкость: смешение тюркского имени с восточнославянским суффиксом даёт нестандартный результат.

Третья, более прозаичная возможность — прозвище от слова «мухала» в местных говорах. В некоторых диалектах юга России и Украины «мухала» означало «мешок, котомка», а «мухалане» — люди, носившие такой мешок, то есть странники или торговцы вразнос. Однако документальных подтверждений этому нет.

География фамилии крайне узкая. По данным открытых источников, носители Мухалане встречаются в основном в Молдавии и на юго-западе Украины (Одесская, Черновицкая области), что усиливает версию о молдавском или украинском суффиксе -ане. В России фамилия практически не фиксируется.

С точки зрения словообразования, самое интересное в Мухалане — это её «незаконченный» вид. Суффикс -ане не даёт фамилии вписаться в стандартные русские модели на -ов, -ин, -ский, поэтому она остаётся на периферии ономастикона. Носителям такой фамилии стоит искать корни в западных областях бывшей Российской империи, где смешивались славянские, тюркские и кавказские именные традиции.