Фамилия Мушкарова образована от личного имени или прозвища Мушкар, а то, что стоит за этой основой, раскрывает сразу две возможные истории предков. Первая версия отсылает к диалектному слову «мушкара» — так в народе называли мошкару, то есть мелких мух и мошек. Имя Мушкар давали ребенку в надежде, что природа примет его как своего: считалось, что через такое имя к человеку переходят полезные качества живого существа. Вторая гипотеза видит в основе не мирское имя, а прозвище Мушкара, которым награждали маленького, юркого человека — за подвижность и неуловимость, сходную с поведением мошки.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: к основе Мушкар- добавили патронимический суффикс -ов, а женская форма Мушкарова указывает на то, что речь идет о дочери или жене носителя мужской фамилии Мушкаров. Такая модель широко распространена в центральной России, где фамилии на -ов/-ев формировались от имен и прозвищ отцов. Интересно, что сама основа с диалектным оттенком встречается реже, чем, скажем, производные от птиц или домашних животных, поэтому фамилию можно считать относительно редкой и локальной.

Ударение в фамилии обычно падает на второй слог — Мушка́рова, хотя в некоторых говорах допустимо смещение на первый. На письме фамилия устойчива, вариант с одной «ш» закрепился исторически, хотя слово «мошкара» в народной этимологии иногда подталкивает к написанию «Мошкарова» — такие формы действительно встречаются как самостоятельные фамилии, но к Мушкаровой они отношения не имеют.

Если говорить о социальном контексте, то фамилия не дворянская и не церковная: она из крестьянской или мещанской среды, где прозвища и мирские имена были обычным делом до XVIII века, когда фамилии начали закрепляться окончательно. Потомок человека по прозвищу Мушкара или носителя имени Мушкар со временем получил фамилию Мушкаров, и она передалась дальше по наследству. Сегодня носительницы фамилии Мушкарова могут встретиться в разных регионах России, но корни стоит искать там, где говорили на диалектах с этим словом — вероятнее всего, в северных и центральных областях.