Фамилия Мутовина — женская форма, а мужская, Мутовин, образована по самой частотной русской модели: с помощью суффикса -ин, который в древности указывал на принадлежность к главе семьи. В основе лежит прозвище или мирское имя Мутовой. Это слово напрямую связано с глаголом «мутить» — в древнерусском языке оно означало не только «делать мутным, взбалтывать», но и «волновать, ссорить, поднимать тревогу». Соответственно, Мутовым могли прозвать человека беспокойного, заводящего распри, или, наоборот, того, кто мутит воду, ловит рыбу бреднем, то есть рыбака.

Есть и другая, более бытовая версия: «мутовка» — предмет кухонной утвари, палочка с лопастями для взбивания. Прозвище Мутовка или Мутовой мог получить либо мастер, делавший такие мутовки, либо человек, которого за внешнюю худобу или суетливость сравнивали с этим приспособлением. В говорах встречается и слово «мутовник» — так называли мешалку для теста, что усиливает связь с ремеслом.

Фамилия довольно редкая, её географические корни, скорее всего, лежат в северных и центральных областях России, где диалектная лексика лучше сохраняла старые значения. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и посадские люди с прозвищем Мутовой, но массовой фиксации фамилии не было — она осталась локальной. В отличие от фамилий на -ов, которые образуются от прилагательных или названий профессий, форма на -ин подчёркивает, что родоначальника звали именно Мутовой, а не Мутов.

Интересно, что фамилия Мутовина не связана с современным словом «мутный» в значении «сомнительный» — в старину прозвище носило конкретный, часто ироничный или профессиональный оттенок. Носители фамилии могут считать, что их предок был либо человеком с живым, неспокойным характером, либо мастеровым, делавшим домашнюю утварь.