Фамилия Наумычев — яркий пример «отчества второго порядка», или патронимической фамилии. Её основа — имя Наумыч, которое в свою очередь происходит от канонического крестильного имени Наум. В русской традиции имя Наум (древнееврейское «утешитель») было широко распространено в крестьянской среде, особенно в северных и центральных губерниях. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Наумычев буквально означает «сын Наумыча», то есть внук (или потомок) человека по имени Наум.

Интересна модель образования: не от самого имени Наум, а от его отчества — Наумыч. Такая двойная патронимия характерна для русских фамилий, сформировавшихся в XVI–XVII веках, когда отчество становилось наследственным. Если бы фамилия образовалась напрямую от имени, мы бы получили Наумов. Наумычев же говорит о том, что родоначальника в быту звали по отцу — Наумыч, и это прозвание закрепилось за его детьми.

Географически фамилия тяготеет к Русскому Северу, Поволжью и Уралу. В переписных книгах и ревизских сказках XVIII–XIX веков Наумычевы встречаются среди государственных крестьян и однодворцев — то есть свободных, но не дворянских сословий. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не зафиксировано, что подтверждает её народное происхождение.

Ономастический словарь Б. Унбегауна относит фамилии на -ычев к типично русским, подчёркивая, что они образовывались от уменьшительных или отчественных форм имени. В случае с Наумычевым перед нами редкий случай, когда в основе лежит не краткая форма, а полноценное отчество, что делает фамилию ценной для историков быта: она сохранила архаичную модель именования, где человека называли не по собственному имени, а по имени его отца.

В некоторых говорах (например, вятских и пермских) имя Наум произносили с ударением на второй слог — Нау́м, что могло повлиять на написание фамилии через «ы» в сочетании с суффиксом. Вариант Наумычев — единственно верный с точки зрения исторической орфографии, хотя в метрических книгах XIX века встречается искажённое «Наумичев» под влиянием церковнославянского написания имени.