Фамилия Недокукин — яркий представитель «отрицательных» русских фамилий, построенных по модели «недо- + основа». В отличие от более распространённых Недосекина или Недорубова, где корень указывает на конкретное действие, основа «кук» здесь ставит в тупик. Чтобы понять значение, нужно отбросить привычное слово «кукла» и обратиться к диалектам.

В русских говорах (особенно северных и сибирских) «кука» — это не только игрушка, но и кулак, а также сжатая в кулак рука. Глагол «куковать» в переносном смысле означал «сидеть сложа руки, бездельничать». Отсюда «кука» — бездельник, человек, который «кукует» без дела. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Недокукин — это «сын Недокуки», то есть человека, который «недокуковал», не доделал дело, бросил работу на полпути. Прозвище Недокука могли дать ленивому или непоследовательному работнику, который не доводил начатое до конца.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия связывает основу с «кук» в значении «комок» или «шишка» (ср. «кукиш»). Тогда Недокука — «недоделанный ком», «недоносок» или человек с физическим изъяном. Однако диалектная поддержка первой версии (связка «кука — кулак — безделье») делает её более убедительной и органичной для русской прозвищной традиции.

Географически фамилия редкая и локальная. По данным переписей и телефонных справочников, основное гнездо Недокукиных — это юг России, особенно Ростовская область и Краснодарский край. Встречается также в Сибири, куда фамилия могла попасть с переселенцами. Сословно это почти наверняка крестьянская или казачья фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали метко и без обиняков.

Суффикс -ин указывает на принадлежность к роду «Недокуки», что типично для фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я. По той же модели построены Недосекин, Недорубов, Недошивин. Сравнение с ними показывает общую логику: все они описывают человека, который чего-то «недо-» сделал — не докосил, не срубил, не сшил. Недокукин в этом ряду — самый загадочный по корню, но самый характерный по смыслу.