Фамилия Никишанов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Никишанов послужило церковное имя Никита. Фамилия Никишанов образована от крестильного мужского имени Никита, точнее – от его производной уменьшительно-ласкательной формы Никишан. Покровителем этого имени читался преподобный Никита Исповедник. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Никишан, со временем получил фамилию Никишанов. О точном месте и времени возникновения фамилии Никишанов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Никишанов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.