Фамилия Никофорова — это женская форма, но в разговоре о происхождении обычно отталкиваются от мужского варианта Никофоров. С первого взгляда кажется, что основа — греческое имя Никифор, что значит «несущий победу». Однако в написании с одной «к» и без «и» после «к» кроется важная деталь: это не книжная, а народная, упрощённая форма. Церковное имя Никифор в бытовой речи часто произносили как «Никофор», отсюда и пошла фамилия. Такое «опрощение» — не редкость для русских фамилий: книжное Никифоров и народное Никофоров — две ветви одного корня, и вторая указывает на то, что предок был скорее крестьянином или ремесленником, а не священником или грамотеем, старавшимся писать имя по уставу.

Суффикс -ов однозначно говорит о том, что фамилия формировалась в центральной России и на севере, в зоне влияния великорусского наречия. В отличие от украинских или белорусских фамилий на -енко или -ук, Никофорова — типично русская по модели, отчество от имени отца. Географически фамилия встречается рассеянно, без ярко выраженного «гнезда», но чаще в Поволжье и на Русском Севере — в тех регионах, где имя Никифор было популярно среди старообрядцев, которые нередко сохраняли архаичные формы произношения.

Спорных версий здесь немного, и самая слабая — попытка связать фамилию со словом «никой» (никто) или с греческим «нике» (победа) напрямую, минуя имя. Это не выдерживает критики: в русской ономастике фамилии от прозвищ на -фор не образуются, а основа явно указывает на крестильное имя. Поэтому, если вы Никофорова, ваш предок с большой вероятностью звался Никифором в простонародном варианте, и фамилия закрепилась за его детьми именно в той форме, в которой имя звучало в семье и на улице, а не в церковных записях.