Фамилия Низена — редкий случай, когда географический корень почти наверняка перевешивает любую другую версию. Она явно не вписывается в типичную русскую модель на -ов, -ин или -ский, а её окончание -а указывает либо на женскую форму, либо на адаптированную иноязычную основу. Скорее всего, перед нами фамилия с немецкими или балтийскими корнями, которая попала в русский контекст через переселенцев или остзейских дворян.

Основа «Низен» восходит к немецкому топониму Niesen или к фамилии Niessen. Niesen — это гора в Бернских Альпах (Швейцария), но как фамилия она чаще встречается в Нидерландах и Северной Германии. Вариант Niessen — патроним от имени Nies, краткой формы от Dionysius (Дионисий). В остзейских губерниях Российской империи (современные Латвия и Эстония) такие фамилии фиксировались у немецких колонистов и обрусевших дворян. Если предки носили фамилию Низена, они могли быть выходцами из прибалтийских немцев или меннонитов, переселившихся на юг России в XVIII–XIX веках.

Суффикс -а в русской передаче — это либо попытка передать окончание женского рода (например, вдова Низена), либо результат адаптации немецкой фамилии, где -en воспринималось как окончание. В некоторых документах фамилия могла писаться как Низен, а форма Низена закрепилась в паспортных записях по ошибке или под влиянием украинского или белорусского произношения, где фамилии на -а встречаются чаще.

С точки зрения социального контекста, носители фамилии Низена в дореволюционной России чаще всего принадлежали к мещанству или духовенству, реже — к дворянству. В дворянских родословных книгах эта фамилия не значится, но в метрических книгах лютеранских приходов Петербурга, Саратова или Одессы она могла фиксироваться у ремесленников, аптекарей и пасторов. После 1917 года многие носители эмигрировали или сменили фамилию на более «русскую» — Низин, Низинов.

Сегодня фамилия Низена остаётся крайне малочисленной. В базах данных современной России она почти не встречается, что подтверждает её локальное происхождение и вероятное угасание ветви. Для человека, ищущего свои корни, главная зацепка — именно немецкая топонимическая основа и связь с Прибалтикой или Поволжьем.