Фамилия Низенькая принадлежит к типу русских фамилий, образованных от прилагательных в краткой форме, и застыла в женском роде. Перед нами не типичная модель с суффиксом -ов/-ев или -ин, а более редкая: фамилия на -ая, -ий, которая напрямую передаёт прозвище. В данном случае основа — «низенький», то есть человек невысокого роста. Такие прозвища были распространены в крестьянской среде: они описывали внешность без обидного оттенка, скорее как бытовую примету. Фамилия могла закрепиться за женщиной, если она была главой семьи или вдовой, но чаще в документах фиксировалась форма женского рода для всей семьи, если мужчина носил прозвище Низенькой. В современных русских фамилиях суффикс -ая встречается реже, чем -ов, и обычно указывает на северные или центральные регионы России, где такие формы бытовали дольше.

Интересно, что у фамилии нет сложной суффиксальной конструкции: она образована напрямую от качественного прилагательного без дополнительных формантов. Это отличает её, например, от фамилии Низовцев (от географического названия) или Низяев (от имени Низя). Однокоренные варианты — Низеньков, Низеньких — встречаются чаще, но Низенькая сохраняет архаичную форму, которая могла бытовать в старых переписных книгах XVII–XVIII веков. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные модели описаны как характерные для «окающих» говоров, где прилагательное в именительном падеже единственного числа женского рода могло становиться фамилией без изменений.

Социальный контекст прост: предки носителя фамилии были, скорее всего, крестьянами или посадскими людьми, которым дали прозвище по росту. Прозвище Низенький не несло негативной окраски в среде, где рост был лишь одной из множества примет. Географически фамилия могла закрепиться в областях, где говорили «низенький» (с ударением на первый слог), а не «низкий» — то есть в северо-восточных и центральных губерниях. Сегодня фамилия редкая, и её носители могут встретиться в основном в России, но точных статистических данных нет. В отличие от фамилий, образованных от уменьшительных форм имён, здесь прозвище осталось максимально прозрачным и не требует сложной расшифровки.