Фамилия Падурин образована от прозвища или нецерковного имени Падура. Основа здесь — глагол «падать» (древнерусское «пасти»). В говорах «падура» называли человека, который часто падает, неуклюжего, неловкого. Но есть и другая, более интересная версия: в южнорусских и украинских диалектах «падура» — это разновидность невода или сети для ловли рыбы. В этом случае родоначальник Падуриных мог быть рыбаком, владельцем такого невода.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Падурин — сын Падуры. Модель образования типична для центральных и северных регионов России. Встречается фамилия в основном в Поволжье, на Среднем Урале и в Сибири — там, где в XVII–XVIII веках оседали переселенцы из центральных областей.

Менее вероятная, но возможная версия связывает основу с диалектным словом «падур» — так в некоторых местах называли падучую болезнь (эпилепсию). Но это скорее исключение: прозвища по болезням давали редко, и они обычно не закреплялись в качестве фамилий.

Фамилия Падурин не относится к дворянским — она крестьянская или посадская. В документах XVII века встречаются крестьяне с этой фамилией в Казанском и Симбирском уездах. Сегодня фамилия редкая, но не исчезающая — её носят несколько тысяч человек в России.