По одной из версий, фамилия Панишко образована от прозвища Панишко, то есть «маленький пан». В старину в Польше, Литве, а также на Украине и в Белоруссии паном называли помещика, дворянина, а также хозяина, господина по отношению к прислуге. Следовательно, прозвище Панишко мог получить сын пана, а фамилия Панишко содержит указание на высокое социальное положение основателя рода. Согласно другой гипотезе, фамилия Панишко образована от имени Панишко – украинской или польской производной формы имени Павел, которое в переводе с латинского означает «маленький». Также не исключено, что имя Панишко является формой имени Пантелеймон (от греческого «всемилостивый»), Панкрат (от греческого «всемогущий») или Панфил (от греческого «всеми любимый»). Так, в Книге памяти Омской области записан украинец Панишко Иван Максимович, который родился в 1882 году в Херсонской губернии, местечке Федорок.