Фамилия Панкрашкина образована от народной уменьшительной формы крестильного имени Панкратий — Панкрашка. В основе лежит древнегреческое имя Панкратий, которое переводится как «всевластный» или «всемогущий» (от слов pan — «всё» и kratos — «сила, власть»). В церковном календаре это имя связано с несколькими раннехристианскими святыми, что обеспечило ему распространение на Руси после Крещения.

Словообразовательная цепочка выглядит так: каноническое Панкратий → разговорное Панкрат → уменьшительное Панкрашка → притяжательное прилагательное Панкрашкин → фамилия Панкрашкина. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Панкрашкина буквально означает «дочь или жена Панкрашки», а в более широком смысле — «из рода Панкрашкиных». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён, прозвищ и профессий.

Уменьшительная форма с суффиксом -к- говорит о бытовом, неофициальном употреблении имени. В старину так могли называть человека в семье, среди соседей или в трудовой среде. Поэтому вероятно, что основатель рода Панкрашкиных был выходцем из рабочей или крестьянской среды — именно в этих слоях населения уменьшительные имена чаще всего закреплялись в качестве родовых прозваний. Фамилии на -ин и -ов в массе своей сформировались в XVI–XVII веках, когда крестьянство и посадские люди начали массово получать наследственные именования.

Интересно, что параллельно с Панкрашкиными существовали и другие фамилии от того же корня: Панкратов, Панкратьев, Панкрашин. Разница в суффиксах отражает разные диалектные формы имени и разные пути образования. Панкратов — от полной формы Панкрат, Панкратьев — от церковной Панкратий, а Панкрашкин и Панкрашин — от уменьшительных вариантов. Такое разнообразие показывает, насколько живым и вариативным было имя в народной среде.

В написании фамилии Панкрашкина встречаются варианты с одной или двумя буквами «ш», но исторически корректной считается форма с двумя, поскольку она точно передаёт уменьшительный суффикс -к- перед окончанием. В документах XIX века можно встретить написание Панкрашкинъ с твёрдым знаком на конце, что соответствовало дореволюционной орфографии.

Сведений о конкретных известных носителях фамилии Панкрашкина в открытых источниках мало, что типично для фамилий, распространённых преимущественно в сельской местности. Географически фамилия чаще встречается в центральных и северных регионах России, где имя Панкратий было особенно популярно в старообрядческой среде.