Фамилия Панкрушина происходит от имени Панкруша, народной уменьшительной формы крестильного мужского имени Панкратий. Святым покровителем этого имени является святой мученик Панкратий Тавроменийский, ученик апостола Павла, а позже епископ. Скорее всего, основатель рода Панкрушиных был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Панкруша, со временем получил фамилию Панкрушина.