Фамилия Панкрушкина — женская форма фамилии Панкрушкин, и ее происхождение напрямую связано с мужским прозвищем, которое звучало необычно даже для русской ономастики. В основе лежит слово «панкрушка» — так в некоторых говорах, особенно на северо-западе России (Псковская, Новгородская области), называли человека с пышной, взбитой шевелюрой или просто неряшливого, лохматого. Корень здесь — «панкруш-», восходящий к глаголу «панкрушить» (путать, взбивать, делать клочковатым), а суффикс «-к-» придаёт слову пренебрежительно-уменьшительный оттенок. Таким образом, Панкрушка — это прозвище, данное по внешнему виду: растрёпанный, с торчащими волосами, либо, в переносном смысле, неаккуратный в делах.

Модель образования фамилии типична для русского быта: от прозвища на -а/-я с помощью патронимического суффикса -ин (Панкрушка → Панкрушкин). Такая схема характерна для фамилий, возникших в крестьянской среде, где прозвища давались по яркой, запоминающейся черте. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образовывались от имён на твёрдый согласный, прозвища на -а требовали суффикса -ин. Интересно, что фамилия Панкрушкин встречается редко, и её география сосредоточена в тех же северо-западных губерниях, где бытовало слово «панкрушка» — Псковской, Новгородской, а также в соседней Тверской. В переписях XIX века носители фамилии почти не фиксируются в центральных и южных регионах, что указывает на локальное происхождение.

Версия о связи с польским или украинским словом «пан» (господин) маловероятна: суффикс «-круш-» нехарактерен для польской ономастики, а сочетание «панкрушка» звучит как искусственное натяжение. Гораздо правдоподобнее, что перед нами чисто русское диалектное прозвище, которое со временем утратило свою описательную силу и закрепилось в фамилии. Носительница фамилии Панкрушкина может с уверенностью предположить, что её предки жили на северо-западе России и получили фамилию от прозвища, данного за неопрятный или, наоборот, слишком пышный вид — в зависимости от контекста, в котором прозвище возникло.