Фамилия Пасенина — это женская форма, а её мужской вариант — Пасенин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Пасеня, которое, скорее всего, образовано от слова «пасеня» или «пасенок» — так в некоторых русских говорах называли пасынка, то есть неродного сына. Слово родственно «пасынок»: приставка па- и корень, связанный с «сын», но с уменьшительным суффиксальным оформлением. Таким образом, Пасеней в крестьянской среде могли прозвать приёмного ребёнка, пасынка, или же человека, который воспитывался не в родной семье.

Модель образования проста и типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность. Пасенин — буквально «чей?» — сын или потомок Пасени. Такая форма была особенно распространена в северных и центральных губерниях России, где отчества и фамилии на -ин активно вытесняли другие варианты. Географически фамилия встречается в Вологодской, Архангельской, Кировской областях, а также в Поволжье — это косвенно подтверждает её диалектное происхождение.

Интересно, что фамилия Пасенин (и Пасенина) не связана с пчеловодством, хотя на слух её легко спутать с «пасенным» от слова «пасека». Ономасты, например, Б. Унбегаун в своём словаре, указывают на чёткое разграничение: фамилии от «пасека» обычно пишутся через «с» — Пасечников, Пасекин. Пасенин же стоит в ряду с фамилиями Пасынков, Пасынковский, то есть имеет семейно-родственный, а не профессиональный корень. Это редкий случай, когда уличное прозвище, данное по статусу в семье, закрепилось как родовое имя.

В дореволюционных переписях Пасенины — это чаще всего государственные крестьяне, реже — однодворцы. Сословного барьера фамилия не имела, но в дворянских родословных книгах она не встречается. Так что предки современного носителя фамилии Пасенина — скорее всего, люди из крестьянской или мещанской среды, а само прозвище напоминает о непростой судьбе того, кого в семье называли «пасеня».