Фамилия Пашкортов — одна из тех, где при внешней простоте корень оказывается неочевидным. На первый взгляд хочется выделить «Паш-» и связать с именем Павел или словом «пахать», но суффикс и окончание подсказывают другую версию.

Модель образования здесь — притяжательное прилагательное с суффиксом -ов-, отвечающее на вопрос «чей?». Значит, в основе лежит личное имя или прозвище Пашкорт. Сама основа — сложная: первая часть «Паш-» — это, скорее всего, краткая форма от имени Павел (Паша), а вторая часть «-корт» — заимствование из тюркских языков. В ряде тюркских наречий «корт» означает «волк» или «червь», но в контексте имени более вероятно значение «сильный, могучий», близкое к эпитету. Таким образом, Пашкорт могло быть составным прозвищем, данным человеку по силе или характеру — что-то вроде «Пашина мощь».

Встречается фамилия редко, что указывает на её локальное происхождение. Скорее всего, она возникла в зоне русско-тюркского пограничья — на Урале, в Поволжье или в Оренбуржье, где смешение языков было обычным делом. Носитель прозвища Пашкорт мог быть крестьянином или казаком, получившим такое имя за физическую стать или боевую удаль.

Написание фамилии устойчиво: с буквой «т» перед окончанием. Встречающийся изредка вариант Пашкордов — ошибка, возникшая из-за привычного озвончения согласного на слух. Этимологически верна форма именно через «т», так как исходное слово «корт» сохраняет глухой звук.