Фамилия Печеницын образована от прозвища или нецерковного имени Печеница. В основе, скорее всего, лежит глагол «печь»: так могли называть мастера-печника, который клал печи. Эта версия выглядит самой правдоподобной, если учесть, что на Руси ремесленников часто именовали по роду занятий, а фамилии на -ын/-ин, как у Печеницына, как раз и указывали на принадлежность потомков такому человеку.

Однако у прозвища есть и другие толкования. В некоторых диалектах слово «печенка» означало «синяк, ушиб». Тогда Печеницей могли прозвать задиристого, драчливого человека, который часто возвращался домой с отметинами. Менее распространённая, но более тёплая версия связывает прозвище с ласкательным «печеночка» — так в говорах называли милого, любимого человека.

Словообразовательная модель здесь прозрачная и типичная для северорусских и центральнорусских фамилий: суффикс -ын присоединялся к основе на -а, подчёркивая, что родоначальник был человеком по прозвищу Печеница. Интересно, что фамилия не получила широкого распространения и осталась довольно редкой, что говорит о её локальном происхождении — вероятно, в одном из регионов, где бытовало такое прозвище.

Стоит отличать Печеницыных от однокоренных Печниковых или Печёнкиных: если первые, скорее всего, произошли от ремесленника, то вторые чаще связывают с блюдом или анатомическим термином. В случае с Печеницыным все три значения — «печник», «драчун» и «любимый» — имеют право на существование, но первое, опирающееся на профессиональную деятельность, исторически наиболее устойчиво.